Vendredi 18.08.2017 FrançaisEnglish 

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Pro

Durant ma thèse, mon principal interlocuteur, et co-directrice, était Sylvie Gourlet-Fleury, responsable de l'équipe Dynamique des forêts naturelles, unité de recherche du CIRAD (Centre International de Recherche en Agronomie et Développement) à Montpellier. Ma directrice de thèse était Sandra Lavorel, responsable de l'équipe Traits fonctionnels et dynamique des écosystèmes alpins, unité de recherche du LECA (Laboratoire d'ÉCologie Alpine) à Grenoble. J'ai travaillé principalement à Paracou, un site expérimental dédié à l'étude des écosystèmes guyanais. J'ai également eu l'occasion d'animer des cours, travaux pratiques et sorties terrain à l'Université Montpellier II.


Softs (free)

 Scientifique

  • R
The R Project for Statistical Computing : un environnement complet pour les statistiques et la représentation graphique des données. Extensions disponibles pour de nombreux types d'analyse.
  • OpenBugs
BUGS (Bayesian inference Using Gibbs Sampling) est un programme d'analyse baésienne adapté aux modèles statistiques complexes inférés par méthodes MCMC (Markov chain Monte Carlo); utilisable à partir de R.
  • Scilab
Scilab: logiciel scientifique de calcul numérique, semblable à Matlab, mais libre et open-source.
JabRef : programme open source et multi-plateformes écrit en Java pour la gestion des bases de données bibliographiques. Utile pour les bases au format BibTex.
LaTable : éditeur de tableaux pour LaTex, produit le code correspondant à la mise en forme réalisée (pour Windows uniquement...).

 Édition de texte et code

  • Tinn-R
Tinn-R: éditeur petit, gratuit, simple et efficace pour l'écriture de scripts R, mais aussi de code HTML,... Intégré à R.
  • TexMaker
TexMaker: éditeur TeX libre et gratuit intégrant un éditeur spécialisé pour la rédaction de documents LaTeX. Assistants disponibles pour l'édition de tables, matrices,... Multi-plateforme.
  • CodeBlocks
CodeBlocks: environnement de déloppement intégré (IDE) pour C/C++ essentiellement.

 Conversion, édition...

  • Imagemagick
Imagemagick: programme complet pour créer, éditer et composer des images. Utile pour convertir des images en fichiers postscript ou eps.
XnView : visualiseur, navigateur & convertisseur multimédia performant. Permet de manipuler des images simplement.
Script écrit en Perl pour convertir des fichiers postscript en fichier eps. Très utile pour éviter les problèmes de bounding box!
Eps2pdf : programme léger pour convertir des fichiers eps au format PDF. Utile pour produire des documents PDF à partir de PdfTex.

 Outis Web

Voici une liste de programmes libres utilisés pour construire et maintenir ce site :
Simple Picture Gallery Manager : en PHP, facile à personnaliser.
  • GalleryMage
GalleryMage : petit programme pour produire des galleries d'images.
  • Dotclear
Dotclear : programme en PHP permettant de gérer un blog.
  • Magpie
Magpie : programme en PHP pour afficher des flux RSS.
  • Feed2Js
Feed2js : service gratuit pour formatter et afficher des flux RSS sur un site, basé sur Magpie.