Liens
Pro
Durant ma thèse, mon principal interlocuteur, et co-directrice, était
Sylvie Gourlet-Fleury, responsable de l'équipe
Dynamique des forêts naturelles, unité de recherche
du CIRAD (Centre International de
Recherche en Agronomie et Développement) à Montpellier. Ma directrice de
thèse était Sandra Lavorel, responsable de l'équipe Traits
fonctionnels et dynamique des écosystèmes alpins, unité de
recherche du LECA
(Laboratoire d'ÉCologie Alpine) à Grenoble. J'ai travaillé
principalement à Paracou, un site expérimental
dédié à l'étude des
écosystèmes guyanais. J'ai également eu l'occasion d'animer des cours, travaux pratiques et sorties terrain
à l'Université Montpellier II.
Softs (free)
Scientifique
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The R Project for Statistical Computing : un environnement complet pour les statistiques et la représentation graphique des données. Extensions disponibles pour de nombreux types d'analyse. |
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BUGS (Bayesian inference Using Gibbs Sampling) est un programme d'analyse baésienne adapté aux modèles statistiques complexes inférés par méthodes MCMC (Markov chain Monte Carlo); utilisable à partir de R. |
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Scilab: logiciel scientifique de calcul numérique, semblable à Matlab, mais libre et open-source. |
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JabRef : programme open source et multi-plateformes écrit en Java pour la gestion des bases de données bibliographiques. Utile pour les bases au format BibTex. |
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LaTable : éditeur de tableaux pour LaTex, produit le code correspondant à la mise en forme réalisée (pour Windows uniquement...). |
Édition de texte et code
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Tinn-R: éditeur petit, gratuit, simple et efficace pour l'écriture de scripts R, mais aussi de code HTML,...
Intégré à R. |
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TexMaker: éditeur TeX libre et gratuit intégrant un éditeur spécialisé pour la rédaction de documents LaTeX. Assistants disponibles pour l'édition de tables, matrices,...
Multi-plateforme. |
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CodeBlocks: environnement de déloppement intégré (IDE) pour C/C++ essentiellement. |
Conversion, édition...
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Imagemagick: programme complet pour créer, éditer et composer des images. Utile pour convertir des images en fichiers postscript ou eps. |
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XnView : visualiseur, navigateur & convertisseur multimédia performant. Permet de manipuler des images simplement. |
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Script écrit en Perl pour convertir des fichiers postscript en fichier eps. Très utile pour éviter les problèmes de bounding box! |
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Eps2pdf : programme léger pour convertir des fichiers eps au format PDF. Utile pour produire des documents PDF à partir de PdfTex. |
Outis Web
Voici une liste de programmes libres utilisés pour construire et maintenir ce site :
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Simple Picture Gallery Manager : en PHP, facile à personnaliser. |
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GalleryMage : petit programme pour produire des galleries d'images. |
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Dotclear : programme en PHP permettant de gérer un blog. |
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Magpie : programme en PHP pour afficher des flux RSS. |
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Feed2js : service gratuit pour formatter et afficher des flux RSS sur un site, basé sur Magpie. |